2021-12-04から1日間の記事一覧

リポジショニングの pitfalls

創薬(wet)アドベントカレンダー 2021 4日目記事。 パンデミックに急いで対応するためになるべく薬を早く使えるようにと、COVID-19 治療薬探索ではリポジショニングを目指した既存薬剤のスクリーニングが盛んに行われた。動態や安全性等が分かっているので、…

AlphaFold2 GPU メモリ使用量測定

創薬(dry)アドベントカレンダー 4日目記事。 AlphaFold2 の推論フェーズでアミノ酸配列長に応じた GPU メモリが必要になる。RAM にスワップして実行させることもできるがとても遅くなるので、GPU メモリに載り切ってくれたほうがよいのだが、Multimer 予測…